Hetzner Cloud, veri güvenliğine önem veren bir dizi güvenlik önlemi sunar. Bu önlemler arasında veri şifrelemesi, güvenlik duvarları, ağ izolasyonu ve düzenli güvenlik güncellemeleri bulunur. Ayrıca kullanıcılar, kendi güvenlik önlemlerini de uygulayabilirler.